本实用新型公开了一种多功能中成药灭菌机，包括有灭菌箱，所述灭菌箱顶部设置有投料口、压力表和真空管，所述灭菌箱底部连接有导料软管，所述灭菌箱内设置有搅拌装置、若干个加热机构和若干块过渡板，所述加热机构与过渡板交替设置，所述加热机构和过渡板均与搅拌装置配合，所述过渡板下侧面设置有灭菌装置；所述搅拌装置包括有设置在灭菌箱顶部的动力电机，所述灭菌箱内设置有转轴，所述转轴一端贯穿灭菌箱顶部与动力电机动力杆连接；本实用新型的一种多功能中成药灭菌机，其结构简单、方便实用，通过加热板、灭菌装置和进气口导入蒸汽，使得灭菌机能够实现3种杀菌模式，避免单一一种杀菌模式出现的缺陷问题。