本发明公开了一种基于结构化报告模板的肺功能定量分析方法，包括以下步骤：步骤S1、在肺功能检测病例大数据中获取所述病例使用的多种结构化报告模板，并将在结构化报告模板中使用生理指标数据定量描述的多个器官组织进行第一主成分分析得到表征病例肺功能状态的主要影响元素的器官组织以作为中心分析主体；步骤S2、在目标对象的历史结构化报告中提取出使用生理指标数据定量描述的多个器官组织，以及依次将每个器官组织在历史结构化报告中的生理指标数据按历史结构化报告的时序链接构成多组器官组织的生理指标时序数据。本发明实现融合医学专家经验和医生个人经验对目标对象的肺功能波动趋势特征进行分析来提高分析准确度。