本发明公开了一种基于超声图像的骨折远近端空间位姿实时获取与配准系统，包括术前数据采集模块、超声图像分割模块、点云获取模块、配准与定位模块、可视化模块。本发明所提出的基于超声影像数据的配准系统通过对超声探头进行改造，添加红外标记球并进行标定，可以准确无创地提取骨表面特征，进而通过配准获取患骨的空间位姿。同时本发明使用超声设备进行术中患骨数据的采集，极大的降低了患者所受到的辐射损害。本发明能够在术中精确定位患骨的位置并与术前重建的模型进行配准，为骨折复位手术提供准确的三维信息，并且系统具有无辐射损害、操作简便、适用各种类型的骨折手术等优点。