本实用新型公开了一种动物肠道微生物取样装置，涉及动物健康检查技术领域。本实用新型包括卡扣插头，卡扣插头的一端通过卡接有卡扣插座，卡扣插头和卡扣插座的另一端均通过胶粘有连接布带，连接布带的一端通过缝纫链接有限位套，限位套的内部开设有放腿孔，限位套外表面的上端通过销钉固定有定位卡杆，定位卡杆的一侧固定有限位套杆。本实用新型针对小型犬类动物，通过针管装取样装置，直接从肛门部位到动物的大肠中取样，避免了取样时需要等待，提高了检测效率，且装置能有效固定在动物的后肢，避免了长期人工固定动物后肢所存在的安全隐患，使得取样过程更加方便和安全。