一种用于连接船载医疗集装箱的通道结构属于船载医疗集装箱配套装置技术领域。本实用新型包括安装框和通道箱，其特征在于，所述安装框固定在船载医疗集装箱的舱门侧外壁上，所述通道箱设置在相邻的两个船载医疗集装箱之间，所述安装框顶部与所述通道箱顶部通过伸缩顶棚连接，所述安装框侧面与所述通道箱的侧面通过伸缩侧帘连接，所述安装框底部与所述通道箱的底部通过可伸缩的通道踏板连接，所述通道踏板与连接在所述安装框上和所述通道箱侧壁上的拉链吊钩相连接，所述通道箱的四侧面均设置有通道门，所述伸缩顶棚内设置有管线综合接口盒。本实用新型可以实现各个集装箱之间的关于水电、通气、通讯的连接以及人员的方便转移。