本发明提供了一种预制井内补偿暗埋管道沉降的系统，目的是解决因地基沉降造成暗埋管道变形或拉裂，影响正常使用，且后期修复困难的问题。提供一种预制井内补偿暗埋管道沉降的系统，包括：操作井，设置在地表；升降安装组件，一端与操作井连接；提升井，位于操作井下方，升降安装组件的另一端延伸至其内部；暗埋管道组件，设置在提升井内，并与升降安装组件连接；暗埋管道组件包括：保护套管，设置在提升井的相对侧壁上；提升管道，套设在保护套管内。本发明通过建立管道沉降补偿机制，在管道覆土完工后，甚至在运营期间，若地基沉降超过允许值，可通过动态提升管道位置，将其复位到设计标高，最终通过后浇支墩，管道形成空间稳定状态。