本发明涉及一种异常流量检测方法、系统和存储介质，所述方法包括：对原始流量样本数据集进行预处理，得到并对第一流量样本数据集进行数据降维，得到第二流量样本数据集；采用预设检测模型对第二流量样本数据集进行迭代训练，得到目标检测模型；根据待检测流量数据和目标异常流量检测模型，生成待检测流量数据的检测结果。本发明通过迭代训练的方式最小化了检测模型的损失函数，通过联合数据降维和密度估计进行约束训练，消除了训练目标不一致的问题，提高了异常流量检测的精准性。