本申请涉及一种磁共振B0涡流补偿方法、系统、存储介质及谱仪设备,涉及磁共振技术的领域，其包括获取三轴梯度信息、B0涡流补偿参数信息、三轴涡流补偿参数信息以及射频脉冲信号；根据三轴梯度信息与B0涡流补偿参数信息以获得零阶相位补偿信息；根据三轴涡流补偿参数信息以对三轴梯度信息进行一阶预加重补偿以获得修正补偿梯度信息；于射频脉冲信号以及修正补偿梯度信息作用下获取预设受体所产生的磁共振信号；将磁共振信号根据零阶相位补偿信息所对应的补偿值进行补偿以获取到补偿信号；根据补偿信号进行图像重建以形成检测图像信息。本申请具有在不增加硬件开销的情况下能解决涡流造成的影响的效果。