本申请涉及一种光子晶体滤波器及其制备方法。方法包括：获取目标对象图像，目标对象图像与光子晶体滤波器的滤波图案相对应；提取目标对象图像中的颜色区域分布信息；调用光子晶体单胞的结构信息与颜色间的预设关系模型，基于颜色区域分布信息，得到目标对象图像中每个颜色区域对应的光子晶体单胞的目标结构信息；其中，光子晶体单胞为螺旋光栅结构；基于颜色区域分布信息和每个颜色区域对应的光子晶体单胞的目标结构信息，确定预设衬底上的目标阵列信息；基于目标阵列信息在预设衬底上进行光子晶体阵列加工，以形成与目标阵列信息对应的目标光子晶体阵列，得到光子晶体滤波器。本申请具有较窄的反射带宽和较高的滤波效率，且不易褪色。