本发明公开一种基于SAMHD1蛋白作为II期结直肠癌疗效预测标志物的方法，应用二维电泳技术对它们进行定量蛋白质组学分析，将肿瘤组织的全蛋白根据等电点和分子量大小的不同进行分离，然后将蛋白的表达水平作为联合指标，可以将II期结直肠癌患者的良好性进行检测，然后将其归一化处理后带入到分析判别方程中，利用这组判别方程即可对结直肠癌样品进行正确分期判断，仅需将该样品的全蛋白采用二维电泳技术进行定量蛋白质组学分析，将图像进行归一化处理，获取蛋白的灰度值，并根据蛋白量进行权重分析，并将其权重数据和灰度值数据代入判别方程，可以用于区分II期结直肠癌辅助化疗敏感和不敏感的患者，为患者后续辅助决策提供治疗依据。