本发明提出一种基于遥感高光谱的矿产资源探测系统，包括数据采集模块、数据融合模块、特征提取模块、模型分析模块以及结果图表生成模块；一种基于遥感高光谱的矿产资源探测系统的探测方法，包括数据获取、数据融合、信息提取及分析以及结果输出四个步骤；本发明通过确定需要探测的地区，并获得该地区的多源高光谱遥感数据，相比单相的高光谱遥感数据，本发明数据采集的更加全面，且能够从多方面提供了目标信息，并利用遥感数据融合技术，能够提升遥感图像数据的精度，继而方便后续的特征提取，从而通过提升采集数据精准度来提升矿产资源探测的效率，同时，无需人工过多的介入，能够适应多地区的矿产资源探测，节省人力物力。