本发明提供了一种综合能源系统优化调度方法及系统，包括：获取综合能源系统内的电网、气网、风机、光伏、能量存储设备和能量转换设备的参数，以及碳交易信息；基于获取的参数和碳交易信息，以用能成本和碳交易成本之和最小化为目标，以能量转换设备约束、能量存储设备约束、联络线功率约束和能量平衡约束为条件，计算一个调度周期所有时刻的电网和气网的传输功率、能量转换设备的输入功率、以及能量存储设备的充电功率和放电功率，对综合能源系统内的电网、气网、能量存储设备和能量转换设备进行全面、准确控制。