本发明公开了一种表面含离子液体层的耐污染分离膜及其制备方法。所述耐污染分离膜的表面含有等量的阴阳离子，膜表面呈现整体电荷平衡。该耐污染分离膜是将离子液体上的阴阳离子单独或同步接枝于分离膜表面，使膜表面整体呈现电中性。分析两性离子耐污染机制可知，其优良的耐污染性能主要源于以下两个结构特征：一是分子内含有的等量阴、阳离子基团可通过溶剂化作用紧密结合水分子，使材料具有优异的亲水特性；二是等量阴阳离子基团同时存在，使得膜面整体呈电中性的特殊结构，其制备方法的原料选择范围广、过程简单温和、可设计性强，易于工业化，制备得到的耐污染分离膜耐污染效果提升显著且结构稳定。