本发明涉及信息技术领域，具体涉及一种基于区块链的档案存储系统，包括档案接收模块、档案存证模块、档案调度模块、档案存储模块和档案压缩存储模块，档案接收模块接收档案和档案描述，档案为电子档案或纸质档案的扫描件，档案存证模块提取档案的哈希值上传区块链存储，档案调度模块建立档案索引表，档案压缩存储模块周期性检查每个档案类型下的档案数量，判断档案重复内容百分比，若重复内容百分比超过预设阈值，则建立共性模板，将档案表示为共性模板和独有内容的叠加。本发明的实质性效果是：实现档案在部门之间的可信共享，能够节省大量的存储空间，减少经费开支。