本发明公开了一种基于建筑屋顶的分布式光伏发电系统，包括光伏组件、光伏控制器和市电电网，所述光伏组件和光伏控制器信号连接，所述光伏控制器与市电电网信电连接，所述光伏组件包括屋顶，所述屋顶上端设置有若干个光伏发电机构，若干个所述光伏发电机构之间共同设置有传动机构，所述光伏发电机构包括底座，所述底座前端左部通过轴承活动穿插连接有第一驱动轴，所述第一驱动轴后端安装有第一同步轮。本发明通过光伏控制器控制第一驱动电机组和第二驱动电机组的输出端旋转方向，使得太阳能板能追随着太阳光转动，提高太阳能利用率，通过设置一个传动机构驱动多个光伏发电机构运转，减少了制造成本以及编程控制难度，利于推广应用。