本发明提供了一种复合骨料净化载体，包括：骨料载体和复合层，所述复合层覆盖在所述骨料载体的表面上，所述复合层由胶黏剂和复合菌混合而成，所述复合菌包括：枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌和粪产碱杆菌，所述胶黏剂包括：聚乙烯醇、海藻酸钠和明胶，所述聚乙烯醇、所述海藻酸钠和所述明胶的浓度比为(30～40)：6：1，所述复合层的厚度为1～2mm，所述胶黏剂与所述复合菌的重量比为8：1。胶黏剂中的海藻酸钠和明胶不仅能够实现胶黏的作用，还能够为复合菌提供养分，使复合菌能够具有更长的生命周期，这样更利于黑臭水体的净化，而且骨料载体、胶黏剂与复合菌均不会污染环境，使得该复合骨料净化载体能够环保地净化污染水体。