本发明公开一种用于科学计算程序的全生命周期管理系统和方法，系统包括构建环境子系统和生产环境子系统，前者为科学计算程序的生命周期过程中的构建过程提供计算机资源；后者为科学计算程序的全生命周期过程中的测试、部署过程提供计算机资源。本发明通过一种科学计算程序的全生命周期的管理方法，在相应的计算资源上操作包含查询、触发调度、构建执行、结果分发和测试部署一系列步骤流程，自动完成科学计算程序的可执行文件的生成及其运行依赖环境的配置；同时，自动生成与其一一对应的记录其全生命周期过程的描述文件；进一步，基于这些描述文件及其集合的版本管理，实现高性能计算环境下科学计算程序的全生命周期追溯及跨平台的迁移部署。