本申请提供了一种深层非饱和带岩土渗透系数的确定方法、装置及电子设备，方法包括：给定目标岩层的初始渗透系数、初始退火温度，分别作为当前最优解和当前退火温度，执行以下求解过程：获取水位随时间变化的实测动态数值及模拟动态数值；计算拟合误差；以拟合误差为目标优化函数，确定指定迭代次数内渗透系数的局部较优解；确定下一个退火温度；以下一个退火温度更新当前退火温度，比较局部较优解和当前最优解分别对应的目标优化函数的值来决定是否以局部较优解更新当前最优解，直到当前退火温度小于预设温度阈值，将当前最优解确定为渗透系数的最优解。该方法可以在钻孔的过程中开展实验，对土体扰动小；方法易操作，成本低，结果可靠。