本发明属于生物炭基肥制备技术领域，公开了一种基于水热碳化法制备生物炭基肥的方法，包括：三相分离餐厨垃圾，获得有机固相物料；将所述有机固相物料与酸性溶剂混合，并水热酸化处理；将所述水热酸化处理的产物泵送至水热反应釜内，180～250℃水热碳化90～240min，反应产物经冷却、脱水、干燥后形成生物炭基；将所述生物炭基与无机化肥、氧化钙、粘结剂、水混合，混合物经挤压造粒得到生物炭基颗粒肥料；综上，在本发明所提供的方法中，以经过三相分离餐厨垃圾后获得的有机固相物料作为水热碳化反应的原料，并且还进行热水酸化预处理，基于此有效解决了反应后产物不纯、高油高盐的缺点，进而有效提高了生物质炭的品质。