本发明提供了一种生态污水处理系统，包括搅拌沉淀池、过滤净化池、二级沉淀池，搅拌沉淀池的左侧设有污水进口，搅拌沉淀池上端设有若干个搅拌电机，搅拌电机下端连接有搅拌叶片，过滤净化池包括沉沙池、过滤池、上浮池，过滤池设置在沉沙池和上浮池之间，沉沙池与过滤池通过隔板二连接，过滤池与上浮池通过隔板三连接，过滤池左上方设有生态种植模块，过滤池右上方设有刮浮模块，过滤池右端设有收集槽，收集槽上方设有冷凝回流管，隔板二和隔板三之间固定有过滤斜管，过滤斜管将过滤池分隔成上下两部分，二级沉淀池右侧设有排水口。本发明处理污水成本低、效率高、能耗低、建设成本低，完善了对污水中有机物的处理，且日常维护、检修方便。