本发明提供了一种医学图像分割方法、装置、存储介质及电子设备。一种医学图像分割方法，包括：获取待分割医学图像；利用已训练的图像分割模型对所述待分割医学图像进行分割，分别得到目标脏器与背景的第一分割结果及目标脏器病灶与背景的第二分割结果，并将所述第一分割结果和所述第二分割结果叠加并进行特征融合，得到背景、目标脏器和目标脏器病灶的第三分割结果。本发明在一个神经网络框架中融合了两种不同的神经网络结构分别对脏器及病灶进行分割，并将两种神经网络结构的分割结果进行融合，得到最终的整体分割结果，解决了脏器与脏器内病灶大小不均匀导致的图像分割问题。