本发明提供一种流动水杀菌装置及饮水设备，流动水杀菌装置，设置在饮水设备的末端，流动水杀菌装置包括壳体、杀菌组件以及缓冲组件，壳体内具有空腔，壳体相对两端分别设有进水口和出水口，进水口和出水口均与空腔连通；杀菌组件设置在壳体内，且位于进水口处，杀菌组件具有面向空腔内部的杀菌光源，以对壳体内的流动水进行杀菌；缓冲组件设置在空腔内，缓冲组件具有至少两个缓冲件，缓冲件连接于壳体内壁，并将空腔分隔成多个腔体，多个腔体依次连通成为迂回状的流动通道，流动通道的第一端与进水口相连通，流动通道的第二端与出水口相连通。本发明结构简单，杀菌效果好。