本申请公开了一种中药材灭菌装置，包括灭菌箱、灭菌机构和位置调节机构，灭菌箱一侧通过转轴安装有密封门，密封门上嵌合有散热扇；灭菌机构包括排气管、消毒灯和蒸汽辅助箱，排气管固接在灭菌箱一侧，灭菌箱远离排气管的另一侧固接有蒸汽辅助箱，蒸汽辅助箱左侧与连接管连接，消毒灯固接在灭菌箱内壁上；位置调节机构安装在灭菌箱内部，灭菌箱内部卡合有挡板，挡板与灭菌箱之间滑动连接。盛放药材的结构可转动调节，便于蒸汽与药材充分接触，提高药材灭菌的效果，挡板可对降温腔左侧密封，减少蒸汽对降温腔内部的干扰；辅助盘的位置可移动调节，消毒灯可对中药材二次灭菌，散热扇可对药材进行降温辅助，避免工作人员取出药材时被烫伤。