本实用新型公开了一种微生物取样检测装置，包括上箱体和下箱体；所述上箱体呈倒U型状，下箱体呈U形状，上箱体可分离地套设在下箱体上，且上箱体与下箱体之间构成一相对封闭的取样腔室；所述上箱体的内腔中设有分隔板，在分隔板上贯穿安装有内螺纹筒；所述内螺纹筒中螺纹连接有丝杆；所述丝杆的上部向上延伸至伸出上箱体的顶部且在延伸末端固定连接有调节手轮；所述丝杆的下部向下延伸至下箱体内腔中且在丝杆的底端固定连接有钻头；通过转动所述调节手轮，以使得丝杆带动钻头上升或者是下降。该装置有效降低了空气中微生物对样本污染的可能性。