本实用新型公开了一体式医用分子筛制氧系统，该分子筛制氧系统旨在解决现在的分子筛制氧生产的氧气容易与存储容器内的亲氧原子结合造成含氧量降低的技术问题。该分子筛制氧系统包括机壳、左右对称安装于所述机壳上端的两组筛管、安装于所述机壳内侧的存储箱，水平设置于所述筛管与所述存储箱之间的冷却管。该分子筛制氧系统采用制冷机控制冷却管在制氧通道中进行冷却降温，令从筛管内进入存储箱的氧气迅速降温，降低氧气的化学活性，减少氧气与内部各种亲氧原子结合的可能，保证氧气制备后的氧含量，利用水压泵配合补水管可以将存储箱表面的冷凝水收集起来循环送入冷却管内，为制冷机提供冷却介质，提高设备的环保性能。