本实用新型提出了一种用于净化农业废料的过滤结构，包括平台、支撑部、箱体及过滤部，平台表面开设用于蓄水的沟槽；沟槽的槽口至少其中一侧内壁边缘开设台阶；支撑部设置在沟槽内；箱体设置在支撑部上，箱体延伸方向的至少其中一端设置第一突出部，第一突出部搭接在台阶上，箱体延伸方向的另一端与沟槽其中一侧内壁抵接，过滤部设置在箱体内，过滤部内设置能够与废水中的污染物进行反应的微生物制品；在沟槽槽口一侧开设台阶，并使箱体的突出部搭接在台阶上，从而使废水顺着平台表面流入沟槽时，会经过搭接在台阶上的第一突出部，从而避免了废水从箱体与沟槽之间的间隙漏出的问题，使废水能够全面的接触箱体内的过滤部。