本实用新型公开了一种多层次浮游生物采集器，涉及水样采集设备技术领域，包括安装板，安装板的顶部一侧安装有收卷器和控制器，收卷器的输出端连接有牵引绳，牵引绳远离收卷器的一端连接有采集箱，安装板的底部另一侧安装有收集箱，收集箱的一侧贯穿有导气管，收集箱的一侧安装有抽气泵，收集箱的顶部贯穿有导液管，安装板的底部安装有驱动器，导液管远离收集箱的一端贯穿至采集箱的内部，导气管连接于抽气泵的输入端，导气管的设置有多个，具有可以快速对多个深度水体的浮游生物进行采样的功能；同时可以获得均匀的水体样本，提高了采样的质量。