本实用新型公开了一种料枪灭菌清洗装置，包括设于冻干机一侧且具有灭菌清洗腔的灭菌清洗罐，所述灭菌清洗罐上分别设有枪进出管、蒸汽入口、清洗水入口和排水口，所述灭菌清洗腔中设有用于放置料枪的输送导轨，所述枪进出管与所述料枪之间设有密封组件。与相关技术相比，采用本实用新型的料枪灭菌清洗装置，可实现对冻干机进料料枪的内部及表面同时进行清洗和灭菌，保证清洗、灭菌效果。在完成进料后，可立即对料枪进行在线清洗和灭菌，清洗灭菌过程中，无需人工去拆卸料枪，减少人工干预及转运工作，省时省力，减小了交叉污染的风险。