本发明提供了一种半导体焊线机高速运动中的补偿方法及系统，其中，所述方法包括：获取第一轴运动时的变量信息；根据所述第一轴运动时的变量信息确定其他轴待补偿的数据信息；根据所述其他轴待补偿的数据信息生成补偿后的设定信息；根据所述补偿后的设定信息对其他轴进行补偿，得到其他轴的结果信息。在本发明中，通过计算一个轴运动时和其他的轴之间的对应关系，计算其中的趋势，并对其他的轴进行补偿，实现减少影响因素的目的，从而达到提高焊接的效率与精度的效果。