本发明公开了一种基于图神经网络的脊椎交互式与自动分割细化方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤一：椎骨CT影像数据的获取；椎骨CT影像数据中包括至少一节段目标脊椎，而预处理这里的指数据增强处理;步骤二：脊椎骨自动粗分割；对步骤一处理完的数据，选取全卷积神经网络，通过训练集对网络进行训练得到模型，再通过测试集使用模型得到粗分割的结果；步骤三：对椎骨粗分割结果进行细化处理；从步骤二获得粗分割结果进行分割细化；主要分为而部分：一是粗分割椎骨轮廓多边形的测量；二是图神经网络模型的建立，并使用图神经网络模得到细化的分割结果.本发明不仅能对能对现有自动分割的结果进行改进，减少注释工作，辅助医生进行下一步工作，同时由于其更加灵活的椎骨切片建模方法，对于全自动的精确分割有一定的指导价值深入研究具有重要意义。