本发明涉及医疗器械技术领域，公开了一种消融装置及其控制方法、设备、存储介质，该装置包括：主控制器、IRE消融电路、脉冲切换电路、清理电路和消融针；主控制器与脉冲切换电路的输入端连接，用于输出控制信号控制脉冲切换电路与IRE消融电路或者清理电路接通；清理电路和IRE消融电路与脉冲切换电路的输出端连接，消融针与清理电路和IRE消融电路连接。本装置先进行不可逆电穿孔消融，不会损伤正常组织细胞，不可逆电穿孔消融完成后，再在进行射频消融，射频消融杀死针道中残留的肿瘤细胞，由于针道残留的肿瘤细胞少，所以只要短时间的射频消融即可杀死残留的肿瘤细胞，不用担心射频消融损伤正常细胞组织，解决了针道残留肿瘤细胞会发生转移的问题。