本发明公开了一种碎软煤层穿地质异常体气液双介质定向成孔系统，包括中心钻具、动力源系统和护孔装置，中心钻具包括依次连接的定向钻头、气液两用螺杆马达、下无磁钻杆、上无磁钻杆和螺旋钻杆；下无磁钻杆侧壁内设置有无线电磁波随钻测量短节，螺旋钻杆的后端连接气液两用器；动力源系统包括制氮机车、泥浆泵车、高压管路与气液转换装置，制氮机车、泥浆泵车均通过高压管路连接至气液两用器；所述护孔装置包括套铣冲击密封钻头和护孔管。本发明利用两种动力源驱动螺杆马达进而驱动定向钻头高效破岩。钻进至地质异常体时采用清水为动力源。实现碎软煤层穿地质异常体定向长钻孔施工，实现安全高效钻进，减少钻孔施工量，提高钻孔瓦斯抽采效果。