本发明公开了一种基于小样本识别的血管重建方法，包括：S1获取获训练样本血管树的CT数据，所述CT数据包括带有血管横截面图像的CT切片与对应的CT值；S2操作员在设备上对部分CT切片中的血管进行标注，获得一组精标注数据；S3基于S2中获得的精标注数据，通过神经网络训练，获得初代识别模型；S4对初代识别模型进行迭代数据扩充训练，最终获得能识别CT切片中的血管并输出结果的识别模型；S5基于S4中获得的识别模型，对待重建血管树的CT数据进行识别，获得血管的空间信息；S6根据S5中获得的空间信息将血管连接，通过后期处理，获得最终的血管树三维模型。该方法在保证识别准确率的同时降低人工标注耗时，提高了识别效率。