本发明涉及基于石墨烯的量子点计算机系统，包括石墨烯量子点运算器、石墨烯量子点控制器、石墨烯量子点存储器、石墨烯量子点指令集组件、量子点计算机总线和量子点计算机I/O接口；石墨烯量子点运算器通过石墨烯量子点的量子位元操作完成可逆的量子算术和逻辑运算；石墨烯量子点控制器包括时序单元、调度单元、用户指令地址存储单元、结果检测单元、数据检验单元和用户指令预判断单元；石墨烯量子点存储器包括呈阵列排列的存储单元和存储单元地址寻址单元。本发明利用石墨烯量子点的物理态双向变迁，实现量子信息的计算和存储，具备较快的计算速度和较大的存储容量；本发明的石墨烯量子点不容易受到外界干扰而产生消相干现象，提高了量子态稳定性。