本发明公开了一种新型的烟气水分含量检测方法及系统，其中检测方法为通过超导约瑟夫森结超导临界电流大小对太赫兹辐照功率的强敏感性，通过测量约瑟夫森结超导临界电流的实时变化量，来对太赫兹波穿过含水烟气的功率衰减值进行检测；再将得到的太赫兹波功率衰减值导入到大气毫米波衰减模型数据库中进行快速查表，最终得到烟气中水分含量的实时数据。本发明提供的方法相比其他已有的工业烟气含水量测定法，具有实时性好且灵敏度更高的优点。