本实用新型公开了一种高效液相色谱仪样品瓶的清洗装置，包括：置瓶盒装置和冲洗盒装置，置瓶盒装置与冲洗盒装置对应设置；其中冲洗盒装置是由冲洗盒，若干高压喷头和进水接口组成；进水接口设置在冲洗盒侧壁上并外接高压水泵；若干高压喷头分布在冲洗盒内，其位置分布与置瓶盒装置内部的样品瓶相对应。将高压水泵的水注入到冲洗盒内，再传输到高压喷头内，通过高压喷头对套设在高压喷头上的样品瓶进行冲洗。本方案通过采用高压反冲洗，在应用时，能够对样品瓶清洗彻底，并代替了人工清洗，具有高效率的特点。