本实用新型涉及生物实验技术领域，且公开了一种生物实验用显微镜的底座固定机构，包括支撑座，所述支撑座的顶部固定连接有支撑腿，所述支撑腿的顶部固定连接有工作台，所述工作台的顶部开设有放置槽，所述放置槽的内壁活动连接有底座主体，所述底座主体的顶部固定连接有显微镜主体。该生物实验用显微镜的底座固定机构，达到了生物实验用显微镜的底座固定机构放置稳定的目的，解决了一般生物实验用显微镜的底座放置不稳定的问题，能够将显微镜的底座固定在工作台上，避免工作台受到碰撞时，显微镜放置不稳定发生显微镜摔落的现象，同时也能够避免显微镜在使用时因为位置偏移造成对观察对象的数据误差，从而提高生物实验的实验效率。