本实用新型公开了一种气水两用医疗器械清洗装置，包括箱体，箱体的底部内壁固定安装有废水箱，废水箱的底部固定安装有第二水泵，第二水泵的输出端套接有循环水管，循环水管的一端套接有水箱，水箱的底部设置有第一水泵，第一水泵的输出端套接有入水管，入水管的内部设置有水阀，入水管的一端固定连接有三通管，三通管的一端固定连接有气管，气管的内部设置有气阀，三通管的底部固定连接有清洁装置，箱体的一侧内壁固定安装有第一电机，第一电机的输出轴转动连接有转杆，通过设置的水阀与气阀结构实现了气水两用的功效，由于三通管的特性让清洁装置可在气体与水流之间相互转换，在经过水流冲洗后可立即采用气体干燥，更加的方便快捷。