本实用新型公开了一种土壤微生物熏蒸装置，包括熏蒸罐，熏蒸罐包括罐体以及密封盖，罐体的内部底端中心处设置有一振动电机，振动电机的输出轴竖直向上设置且连接一固定杆，固定杆沿上其轴向方向上固定有数层土壤样品杯放置结构；罐体底端且对应防腐蚀隔热罩的外侧为熏蒸加热区；罐体上设置有侧电加热板、温控装置；密封盖的顶部通过气体管路与设置于外部的真空泵相连通；密封盖的顶部还设置有一排气管。本实用新型让置于土壤样品杯内的土壤样品在熏蒸培养处理阶段能够不断翻动，增加蒸汽与土壤样品内部微生物的接触，同时土壤样品杯的位置亦可调节，实现了对土壤的全面、彻底熏蒸，提高熏蒸效率，缩短熏蒸时间。