本实用新型实施例公开了一种电源保护系统，所述电源保护系统包括控制器、微处理器以及桥臂驱动电路；控制器包括防直通保护模块以及输出使能模块，防直通保护模块用于当检测到微处理器发送的桥臂驱动输入信号的上管驱动输入信号以及下管驱动输入信号均为高电平时，将上管驱动输入信号转换为低电平并与下管驱动输入信号相结合从而得到转换为低电平的下管驱动输出信号；输出使能模块用于将上管驱动输入信号的高电平作为上管驱动输出信号，将下管驱动输出信号以及上管驱动输出信号输出至电源保护系统中的桥臂驱动电路，以控制桥臂驱动电路的MOS管的导通。本实用新型实施例能够提高电源保护系统的集成度，有效降低成本，提高产品整体可靠性。