本实用新型公开了一种重型商用车电子风扇控制系统，包括整车传感器、车辆控制器ECU、风扇控制器FCU以及电子风扇，所述风扇控制器FCU的外表面设置有风扇控制器外壳，所述风扇控制器外壳上分别设置有第一端口、第二端口与第三端口。本实用新型中，采用独立风扇控制器，与传统集成控制器相比，具有更快的运算速度，便于控制器的维护和故障检查，对于匹配不同类型风扇的车辆，可以通过刷写风扇性能参数实现FCU设备更新,设备互换性强，便于推广，同时通过设置的可调节风速，适用于不同车辆运行工况，能够实现精准控制，有效减少发动机过热或者冷却过度问题，有效提高燃油经济性，风扇消耗功率预估减少3％。