本实用新型提供一种模块化通风空调机组及具有其的集装箱式负压医疗单元，其中，机组为长方体空调箱体，该箱体由框架及面板构成，内部隔板将机组分为新风单元、排风单元和热交换单元三个部分，新风单元依次包括新风入口、粗效过滤段、送风风机段、表冷段、再热段等结构；排风单元依次包括排风进风段、排风高效过滤段、排风风机段等结构；热交换单元包括新风预热或预冷、新风再热和生活热水预热三部分。本实用新型提供了一种可便于运输、安装和维修的模块化通风空调机组及具有其的集装箱式负压医疗单元，可实现温湿度控制、压差控制、风量控制和空气净化等要求，具有轻量化、标准化、成本低及多用途的优点。