本实用新型公开了一种海洋环境调查用防堵塞的海水自动采集装置，包括防护外壳、伸缩杆、隔离环、过滤网和滑杆，所述防护外壳的内部贯穿连接有收集管，所述收集管的下端内部安装有电磁阀，所述伸缩杆对称安装在防护外壳的外部两侧，且伸缩杆的上表面焊接有顶板，所述防护外壳的上端内部两侧均转动连接有丝杆，所述防护外壳的内部转动连接有侧边齿轮，所述隔离环活动连接在收集管的内部，所述搅拌棒的上表面焊接有圆筒，且圆筒的外部开设有外部滑槽。该海洋环境调查用防堵塞的海水自动采集装置，采用新型的结构设计，使得本装置在取样时对取样口进行搅拌，避免取样口堵塞，且该装置内部设置有过滤结构，提高了海水取样的质量。