本发明公开了一种数控机床加工坐标原点自动安全部署的方法，首先对测量机床固定定位位置，并存储于机床系统中备用；根据机床工装装夹结构编写相应宏程序，并植入机床系统；根据机床设备结构编写CAM后置文件，增加捕捉装夹原点与加工原点的位置关系，后置文件结合CAM软件编程，并处理出NC程序；按CAM编程工艺文件，人工或机械手将工件装夹到位即可启动机床加工，如果安全性检查未通过则给出机床报警提示并停止加工；本发明偏移量借助软件自动计算，降低刀具与工装夹具干涉的可能，提高加工安全性，大量节约现场操作调机时间，降低操作难度，减少对操作人员技能的依赖。