一种液相选择加氢反应中炔烃或二烯烃含量的控制方法、控制系统及液相选择加氢反应系统。控制方法包括：实时采集反应系统的可测参数，所述可测参数包括：反应器出口的炔烃或二烯烃含量、液相循环油流量；将采集到的可测参数作为炔烃或二烯烃含量控制的输入量，分程自动调节液相循环油流量及进入反应系统的补充配氢量，从而调整通过溶解进入反应系统的配氢量及直接进入反应系统的配氢量，最终实现进入反应系统的总氢气量的调整。本发明确保反应所需氢气通过溶解的方式配入以提高加氢反应选择性，同时实现反应器出口炔烃或二烯烃的卡边安全控制，且避免过量配氢，提高控制质量，有效应对原料大范围波动。