本发明属于薄膜材料技术领域，具体为基于光子准晶材料的透明隔热防紫外线复合薄膜及其制备方法。本发明复合薄膜结构为透明基底层、光子准晶功能薄膜层、粘合剂层和可剥离层；光子准晶薄膜由三维有序堆积排列的聚合物核壳结构微球与红外功能纳米粒子通过特定工艺形成，拥有可调的结构色彩和光学透明性。可通过调控核壳微球的核微球大小、壳层厚度、折光指数以及红外功能纳米粒子含量来调控薄膜的结构色彩、透明度以及阻隔紫外及红外的波长范围，也可通过调控厚度来控制紫外及红外的阻隔效率。本发明形成的复合薄膜，紫外光阻隔效率高，可见光透过率大，隔热效果好，具有优异的透明隔热防紫外线及防爆性能；可用于汽车及建筑玻璃的节能及防爆等。