本发明提供了一种协调列车时刻表的城市轨道交通高峰期限流优化方法。该方法包括：收集城市轨道交通AFC数据和列车计划运行时刻表数据，并对收集的数据进行处理，获得高峰时期时变乘客到站率、下车率和列车区间运行时间；基于设定的假设条件，建立协调列车时刻表的城市轨道交通高峰期限流措施优化模型，限流措施协同优化模型的目标函数为最小化等待的乘客数量；对所提出的列车时刻表和限流措施协同优化模型进行求解，得到城市轨道交通高峰期限流优化方案。本发明法可以用来协同优化城市轨道交通列车时刻表和限流措施，合理设置客流管理措施和时刻表开行方案，提高城市轨道交通系统内部的运营安全性和乘客安全性，降低部分车站乘客的长时间滞留。