一种水流相向流动的滤水净化系统及净水器，净水器通过一种水流相向流动的滤水净化系统进行脱盐过滤，滤水净化系统的EDR单元中设置有多条水路，相邻水路的水流方向相反，水路包括浓水水路和纯水水路，浓水水路与纯水水路相邻。浓水水路的水流方向与纯水水路的水流方向平行且水流方向相反，浓水水路的出口靠近纯水水路的出水口，纯水水路的出口靠近浓水水路的出水口。通过不同浓度的水路的水流方向相反，能够降低对离子交换膜两侧的压力差，提高EDR单元对盐离子的脱盐过滤效果，降低EDR单元的更换频率，延长净水器的使用寿命。