本实用新型涉及干细胞分离技术领域，尤其涉及一种月经血干细胞用分离器，包括分离器本体，分离器本体的顶部设有密封盖，密封盖的顶部一侧设有月经血进口，分离器本体的底部设有血浆出口，分离器本体的内部设有多个相互连通的分离室，多个分离室的内部分别设有滤网，分离器本体的内部设有穿过多个分离室以及滤网的搅拌装置，搅拌装置与所述密封盖转动连接；分离器本体的外部设有加热装置。采用上述结构的分离器，实现了对月经血中子宫内膜组织、干细胞、红细胞和白细胞的分离，而且在分离时通过搅拌装置可促进血液的流动性，通过加热装置可防止血液凝固，防止子宫内膜组织吸附血液，大大提高了分离效率，而且操作简单。