本实用新型涉及保护膜生产设备技术领域，尤其涉及一种保护膜废料清理装置，包括底板，所述底板的上端设置有机械手机构、位于机械手机构左侧的第一清理机构和位于机械手机构右侧的第二清理机构，所述第一清理机构和所述第二清理机构结构相同；所述机械手机构包括移动支架和用于驱动移动支架移动的第一驱动机构，所述移动支架的上端设置有机械手；所述第一清理机构包括固定设置于底板上端的固定座，所述固定座的上端设置有第一固定支架，所述第一固定支架上设置有转动辊和用于驱动转动辊滚动工作的第二驱动机构，所述转动辊的外圆周设置毛刷，本实用新型通过毛刷对保护膜裁剪后的端面上残留的粉尘进行清理，结构简单，操作方便。